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Genomas de Oceanía ofrecen nuevas pistas sobre la evolución humana

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Un nuevo estudio dirigido por la Universidad de Yale proporciona uno de los análisis más detallados y completos hasta la fecha sobre la variación genética en las poblaciones humanas de Oceanía, lo que llena un importante vacío en la representación de la investigación genómica.

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Crédito de la imagen: Tucci Lab

A pesar de albergar una diversidad notable, las poblaciones de esa vasta región del Pacífico Sur han sido históricamente pasadas por alto en los estudios genéticos humanos globales, que a menudo se han centrado principalmente en personas de ascendencia europea, según afirman los investigadores.

«La drástica subrepresentación de los habitantes de Oceanía limita nuestra comprensión de la evolución humana y podría exacerbar las desigualdades en materia de salud a medida que se utiliza la investigación genómica para desarrollar nuevos tratamientos médicos», afirmó la autora principal, Serena Tucci, profesora adjunta de antropología en la Facultad de Artes y Ciencias de Yale e investigadora principal del Laboratorio de Genómica Evolutiva Humana de Yale. «Para subsanar esta deficiencia, mi equipo de investigación emprendió un proyecto a gran escala para ampliar el conocimiento sobre la variación genética humana, incluidas las variantes genéticas heredadas de homininos extintos».

El estudio, publicado ayer en la revista Science, muestra cómo los genes que los humanos antiguos adquirieron tras aparearse con homininos extintos siguen dando forma a la biología, la salud y la supervivencia de nuestra especie en la actualidad.

Para el estudio, el equipo de investigación secuenció los genomas de 177 individuos de 12 poblaciones distintas en diferentes partes de Oceanía Cercana —la porción suroccidental de la región del Pacífico que incluye Papúa Nueva Guinea, el archipiélago de Bismarck y las Islas Salomón— y los analizó junto con un conjunto de datos masivo de 1284 genomas publicados previamente de individuos de todo el mundo.

Al rastrear la historia de los primeros pobladores del Pacífico, quienes migraron a la región hace al menos 45.000 años, los investigadores descubrieron datos sin precedentes sobre la historia evolutiva y la adaptación humanas. Por ejemplo, hallaron que los ancestros de las poblaciones del Océano Índico se aparearon con al menos tres grupos distintos emparentados con los denisovanos, un enigmático grupo de homininos descubierto inicialmente a partir de fragmentos fósiles en Siberia.

“Estudios previos demostraron que el ADN heredado de homininos extintos, como los neandertales y los denisovanos, sobrevive, disperso, en los genomas de las poblaciones humanas actuales”, afirmó Tucci. “Con este estudio, hemos ido más allá de simplemente ‘resucitar’ este ADN, demostrando cómo activa y desactiva genes activamente, lo cual supone un avance revolucionario. Este ADN no es solo un vestigio de antiguas relaciones; continúa influyendo en nuestra biología hoy en día”.

Según el investigador, el apareamiento entre los humanos antiguos y los denisovanos dejó un legado de numerosas variantes genéticas, incluidas algunas que contribuyen a funciones presentes en los humanos actuales.

Para este nuevo estudio, los investigadores utilizaron una técnica genómica funcional avanzada, conocida como “ensayo de reportero masivamente paralelo”, para evaluar físicamente las consecuencias funcionales de estas variantes genéticas e identificaron más de 3100 que alteran la expresión génica. Según los investigadores, este análisis proporcionó algunas de las evidencias a mayor escala sobre cómo funcionan en los humanos actuales las variantes genéticas adaptativas específicas heredadas de los denisovanos.

Descubrieron que una proporción sustancial de estas variantes adaptativas y funcionales afectaba la vía de señalización del interferón gamma, un componente vital del sistema inmunitario humano que defiende contra los patógenos infecciosos.

«El ADN de homininos extintos —denisovanos y neandertales— facilitó la adaptación humana a los diversos entornos que encontraron las personas al migrar a esta región del mundo», afirmó Patrick Reilly, primer autor del estudio e investigador asociado del Laboratorio de Genómica Evolutiva Humana de Yale, perteneciente al Departamento de Antropología. «Los patógenos constituyen una de las presiones selectivas más importantes —factores ambientales que afectan nuestra capacidad de supervivencia— a lo largo de la evolución humana. Hemos encontrado evidencia de que los genes heredados de los denisovanos reforzaron la inmunidad a los virus y bacterias que los humanos antiguos encontraron en Oceanía Cercana».

El estudio también reveló que el ADN denisovano influye en el desarrollo esquelético. Los investigadores descubrieron variantes adaptativas heredadas de los denisovanos en un gen específico llamado TRPS1. Este mismo gen ha estado sometido a una fuerte selección positiva en los cazadores-recolectores de la selva tropical de África central y en las poblaciones de las tierras altas de Ecuador, lo que demuestra cómo la evolución puede dar lugar a adaptaciones locales recurrentes en diferentes regiones del mundo.

“Si bien los denisovanos desaparecieron de la Tierra hace miles de años, esta investigación demuestra que nuestras historias siguen profundamente entrelazadas”, dijo Tucci.

Cita
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Entre los coautores del estudio se encuentran Daniela Tejada-Martinez, Samantha L. Miller, Audrey Tjahjadi, Chang Liu y Alysa Pomer del Laboratorio de Genómica Evolutiva Humana de Yale; Stephen Rong, Jared Akers, Margaret E. Prentice y Steven K. Reilly de la Facultad de Medicina de Yale; D. Andrew Merriwether de la Universidad de Binghamton; Françoise R. Friedlaender y Jonathan S. Friedlaender de la Universidad de Temple; y George Koki del Instituto de Investigación Médica de Papúa Nueva Guinea.
  • El estudio Long-term isolation and archaic introgression shape functional genetic variation in Near Oceania (El aislamiento a largo plazo y la introgresión arcaica dan forma a la variación genética funcional en Oceanía Cercana), fue publicado en la revista Science. Autores: Patrick F. Reilly, Stephen Rong, Daniela Tejada-Martinez, Samantha L. Miller, Audrey Tjahjadi, Chang Liu, Jared Akers, Alysa Pomer, Margaret E. Prentice, D. Andrew Merriwether, Françoise R. Friedlaender, George Koki, Jonathan S. Friedlaender, Steven K. Reilly, and Serena Tucci

Financiación
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La investigación contó con el apoyo del Instituto Nacional de Ciencias Médicas Generales y del Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano de los Institutos Nacionales de Salud de Estados Unidos.



Contacto [Notaspampeanas](mailto: notaspampeanas@gmail.com)


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